The role of charge, hydrophobicity, and cooperativity in target search of SOX2 and ESRRB
本論文は、単分子イメージングとゲノム解析を組み合わせることで、SOX2 と ESRRB という多能性転写因子の標的探索効率と特異性が、その電荷・疎水性といった物性および TF 間の協働性によってどのように決定されるかを解明したものである。
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molecular biology
204 件の論文
分子生物学は、命の仕組みを最小単位である分子レベルで解き明かす学問です。DNA からタンパク質まで、細胞がどのように動き、情報を伝え、生命活動を支えているのかを明らかにするこの分野は、現代医学やバイオテクノロジーの基盤となっています。
Gist.Science では、bioRxiv から投稿される分子生物学の最新プレプリントをすべて網羅的に収集し、専門家の手で解説しています。難解な専門用語を噛み砕いた平易な要約と、深い洞察が得られる技術的な詳細の両方を提供することで、研究者だけでなく広く科学に興味を持つ方々も最新の知見をすぐに取り込めるようにしています。
以下に、bioRxiv から新たに公開された分子生物学の論文リストを掲載します。最新の研究動向をぜひご覧ください。
CNOT6 deadenylase safeguards postnatal growth and metabolic transition via Fgf21 mRNA decay
本研究は、CNOT6 デアデニラーゼが Fgf21 mRNA の分解を介して FGF21 の発現を抑制し、新生児期の成長と代謝の転換を制御する新たな分子メカニズムを解明したことを報告しています。
Exploring RNA conformational ensembles in silico: progress and challenges
本論文は、RNA の構造多様性とエネルギー地形の複雑さを踏まえ、サンプリング効率や力場精度などの課題を事例を通じて論じつつ、実験データとの統合や機械学習の活用といった将来展望を提示することで、計算機シミュレーションによる RNA 構造アンサンブルの探索における進展と課題を総括しています。
Histone variant H2A.Z mutant suppresses the senescence-associated secretory phenotype
ヒストンバリアント H2A.Z の変異体がヌクレオソームの不安定化を引き起こすことで、細胞周期遺伝子への影響なしに、H3K27ac の減少を介して細胞老化に伴う分泌現象（SASP）を抑制することが示されました。
Interrogating the Mechanisms of Cas9-mediated Allele Conversion
本研究では、ホモログな対立遺伝子を鋳型として変異を修復する「対立遺伝子変換」のメカニズムを解明し、その効率を高めるための新しい細胞モデル（CHACR）と DNA 修復経路の調節因子を同定しました。
WITHDRAWN: The effects of estrogen on cardiac progenitor cell-derived extracellular vesicles in enhancing cardiac protection through promoting tissue repair and regeneration
この論文は、追加データの取り込みと大幅な改訂のため著者によって撤回され、引用を希望されていないため、エストロゲンが心筋前駆細胞由来の細胞外小胞を介して心臓保護や組織修復・再生に及ぼす影響に関する具体的な知見は含まれていません。
Antisense oligonucleotide allele-specific targeting of EFEMP1 in a patient-derived model of Doyne honeycomb retinal dystrophy
この論文は、ドイーン・ハニカム網膜ジストロフィーの原因遺伝子変異を特異的に標的とするアンチセンスオリゴヌクレオチドを用いることで、患者由来の疾患モデルにおいて異常なタンパク質蓄積や脂質蓄積を解消し、治療可能性を実証したことを報告しています。
INTERPOLATION-BASED CONDITIONING OF FLOW MATCHING MODELS FOR BIOISOSTERIC LIGAND DESIGN
本論文は、高品質な分子生成が可能な 3 次元フローマッチングモデルを、再学習なしで種子リガンドやフラグメントセットに基づいて形状や薬理基盤パターンを保持しつつ生体等価リガンドを設計できるよう、2 つの推論時条件付け戦略（Interpolate-Integrate と Replacement Guidance）を導入し、天然物リガンドのホッピングやフラグメント・薬理基盤の統合といった創薬タスクにおける有効性を示したものである。
HAMMER: Hairpin-based APOBEC3A-mediated mRNA editing reporter
本研究では、APOBEC3A による RNA 編集活性を迅速かつ定量的に測定し、その阻害剤を評価するための新規ルシフェラーゼベースの細胞アッセイ「HAMMER」を開発した。
MRE11 suppresses germline mutagenesis at meiotic double-strand breaks in mice
この論文は、マウスの減数分裂において、MRE11 が SPO11 による二本鎖切断の異常な二重切断を抑制し、TDP2 を介した末端結合を防ぐことで、ゲノム進化を形作る新たな変異の起源を制御していることを明らかにした。