FACT safeguards promoter topology by maintaining nucleosomes and restricting chromatin factor spreading
FACT 複合体は、ヒストンの維持を通じてプロモーターのナノスケールドメインを保護し、転写因子の拡散を制限することで、局所的かつ長距離的なクロマチン構造の整合性を維持する重要な役割を果たしていることが示されました。
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molecular biology
376 件の論文
ZNF121 recruits YTHDF2 to modulate mRNA stability
本論文は、ZNF121 が YTHDF2 のリクルーターとして機能し、m6A 修飾の有無にかかわらず標的 mRNA の安定性を制御することで、細胞周期や DNA 損傷応答を調節する新たなメカニズムを解明したことを報告しています。
The amyloid packing difference: a pairwise comparison metric for amyloid structures
この論文は、異なる疾患に関連するアミロイド構造を区別し、同一疾患内の構造を分類するための定量的な指標として「アミロイドパッキング差（APD）」を提案し、その有効性を複数のタンパク質のデータで実証したものである。
p63 and p73 regulate convergent and factor-specific transcriptional programs in cutaneous squamous cell carcinoma
本研究は、皮膚扁平上皮癌において p63 と p73 が共有エンハンサーを結合して増殖を維持する共通プログラムを制御すると同時に、それぞれ上皮系や DNA 複製など因子特異的な転写プログラムを駆動し、アミレグリンを介した EGFR 信号増幅を通じて腫瘍維持に不可欠であることを明らかにしました。
PARP6-dependent vimentin ADP-ribosylation prevents myofibroblast activation in cardiac fibrosis
本研究は、PARP6 がビメンチンの ADP-リボシル化を介して RhoA 経路を抑制し、心臓線維芽細胞の活性化と心臓線維化を防ぐ心保護メカニズムを明らかにしたことを示しています。
Vector-enabled metagenomics reveals the first detection of the geminivirus beet curly top Iran virus in Europe
ベクター昆虫を用いたメタゲノム解析とローリングサークル増幅法を組み合わせることで、欧州においてイランビートカーリートップウイルス（BCTIV）の初検出と、その新たな宿主植物の同定に成功しました。
Structural and functional characterisation of the dextran utilisome from Bacteroides thetaiotaomicron
本論文は、X 線結晶構造解析と単粒子クライオ電子顕微鏡法を駆使して、ヒト腸内細菌 Bacteroides thetaiotaomicron のデキストラン利用複合体（デキストラン・ユティリソーム）の高分解能構造と機能的ダイナミクスを解明し、その基質結合様式や開閉状態の可視化を通じて、単純糖質の取り込みに関わるユティリソームの共通性と多様性を定義したものである。
CUTS RNA Biosensor for the Real-Time Detection of TDP-43 Loss-of-Function
本論文は、TDP-43 の機能低下をリアルタイムで検出・定量可能な RNA バイオセンサー「CUTS」を開発し、神経変性疾患の病態評価や自己制御型遺伝子治療への応用可能性を示したものである。
NPM1 mislocalization mediated by RNA Pol I inhibition alters chromatin landscape
RNA ポリメラーゼ I の阻害は NPM1 の核内局在異常を引き起こし、HDAC1 や SUV39H1 などの酵素を介してヒストン修飾や DNA メチル化を変化させ、結果として核内 3 次元構造やクロマチンの全体的なランドスケープを再編成する。
A novel RAB5 binding site in human VPS34-CII that is likely the primordial site in eukaryotic evolution
本研究は、VPS34-CII が RAB5-GTP を結合する新たな部位（VPS15 領域）を有し、これが VPS34-C2 領域の結合部位よりも進化的に原始的である可能性を示すとともに、真核生物の進化過程で結合部位が 1 つから 2 つへ増えることでエンドソーム系の複雑化への適応が促進されたと結論付けています。
Prevalence and Molecular Detection of Pasteurella multocida, Mannheimia hemolytica, and Bibersteinia trehalosi in Sheep, Western Oromia, Ethiopia
エチオピア西部オロミア州の羊を対象とした調査により、肺炎性パステウレラ症の有病率は 21.1% で、特に有病羊や若齢羊において P. multocida、M. haemolytica、B. trehalosi の感染リスクが有意に高いことが分子検出法により確認された。
Cooperative and competitive interactions among transcription regulatory elements modulate transcription output
本研究では、新しいアッセイ手法 CIERA-seq を用いてプロモーターとエンハンサーが転写機械の補完的な供給を通じて協調的に、あるいは競合的に相互作用し、転写出力を調節する新たな枠組みを提唱しました。
Accurate quantification of canine mitochondrial DNA copy number and its evaluation as a biomarker of brain injury
本研究では、脳損傷後の細胞死に伴うミトコンドリア DNA の血中放出を検出する新たな手法を開発し、犬の急性脳損傷のバイオマーカーとしての可能性を初めて示しました。
Protocol for rapid allelic discrimination qPCR genotyping of the Winnie mouse model
本論文は、炎症性腸疾患モデルである Winnie マウス（Muc2 遺伝子変異保有）の遺伝子型を、試薬処理を要しない粗 DNA 抽出と TaqMan 法を用いた単一反応のリアルタイム PCR により迅速に判別するためのプロトコルを提示しています。
A Multi-Modal AI/ML-based Framework for Protein Conformation Selection and Prediction in Drug Discovery Applications
本論文は、グローバルおよびローカルなタンパク質記述子を統合したグラフ畳み込みネットワーク（GCN）に基づくマルチモーダル AI/ML フレームワークを提案し、タンパク質のコンフォメーション選択と予測の精度向上を通じて創薬プロセスの効率化を図るものである。
The role of charge, hydrophobicity, and cooperativity in target search of SOX2 and ESRRB
本論文は、単分子イメージングとゲノム解析を組み合わせることで、SOX2 と ESRRB という多能性転写因子の標的探索効率と特異性が、その電荷・疎水性といった物性および TF 間の協働性によってどのように決定されるかを解明したものである。
Loop Extrusion Accelerates Long-Range Enhancer-Promoter Searches in Living Embryos
この論文は、生きたショウジョウバエ胚における定量イメージング、遺伝操作、ポリマーシミュレーションを組み合わせ、コヒーシンによるループ抽出がエンハンサーの拡散を促進し、テザー要素との相互作用を介して長距離のエンハンサー - プロモーター接触を加速して遺伝子発現を制御する「スキャン＆スナッグ」モデルを提唱したものである。
Insulin resistance modifies longitudinal multi-omics responses to habitual diet
この研究は、インスリン感受性の高い個人ほど食事とオミクスデータの関連が強く、代謝の柔軟性が食事への反応性を決定し、 Parabacteroides 属菌が精製炭水化物と代謝シグナルの仲介役となり得ることを示し、個別化栄養と心血管疾患予防の新たな知見を提供した。
A PERK/FOXO1 AXIS LINKS DNA DAMAGE TO FIBROBLAST SURVIVAL IN DIFFUSE CUTANEOUS SYSTEMIC SCLEROSIS
この論文は、広範なDNA損傷を負いながらアポトーシスを回避して生存を続ける線維症の線維芽細胞が、PERK/ATF4/FOXO1シグナル経路を介した代謝適応プログラムに依存しており、この経路を阻害することで選択的にアポトーシスを誘導できる新たな治療戦略を示唆していることを報告しています。
CNOT6 deadenylase safeguards postnatal growth and metabolic transition via Fgf21 mRNA decay
本研究は、CNOT6 デアデニラーゼが Fgf21 mRNA の分解を介して FGF21 の発現を抑制し、新生児期の成長と代謝の転換を制御する新たな分子メカニズムを解明したことを報告しています。